二手GC-MS氣質聯用儀被廣泛應用于復雜組分的分離與鑒定，其具有GC的高分辨率和質譜的高靈敏度，是生物樣品中藥物與代謝物定性定量的有效工具。其是一個氣體運行的系統，因而儀器的密封性相當重要。需要留意這些問題，換柱：毛細管柱進入質譜腔中的長度不適當，太長或太短都不行。墊圈要松緊合適，太松會有漏氣的隱患，太緊則會壓碎墊圈，每次更換色譜柱時需要更換新的密封墊圈。 清洗離子源時打開腔體后要注意其密封性。
二手GC-MS氣質聯用儀性能：
分辨率：質譜分辨相鄰兩個離子質量的能力，質量分析器的類型決定了質譜儀的分辨能力。四極桿質量分析器的分辨率一般為單位質量分辨力。
質量軸穩定性：是指在一定條件下，一定時間內質量標尺發生偏移的程度，一般多以24h內某一質量測定值的變化來表示。
質量準確度：為離子質量測定的準確性，與分辨率一樣取決于質量分析器的類型。
掃描速度：每秒鐘掃描的最大質量數，是數據采集的一個基本參數，對于獲得合理的譜圖和好的峰形有好的影響。
二手GC-MS氣質聯用儀的氣體接口是GC和MS之間的連接部分，常見的連接方法是直接連接方法。毛細管色譜柱直接引入質譜儀，并用石墨墊片密封。必須加熱接口以防止分離的組件冷凝。界面溫度一般設置為氣相色譜的最大程序升溫值。
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